Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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