Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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