Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm17322-201ENSMUST00000181289 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Prim1-205ENSMUST00000178041 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Supt7l-202ENSMUST00000200721 1657 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ehmt1-201ENSMUST00000046227 4554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms