Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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