Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms