Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms