Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms