Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms