Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CadB2RQC6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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