Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde4bB1AWC9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde4bB1AWC9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms