Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms