Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprsB0V2N1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms