Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms