Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms