Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec16aA2AIX1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms