Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap5A2AGT5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap5A2AGT5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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