Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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PtprfA2A8L5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PtprfA2A8L5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms