Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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