Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Psmb3Q9R1P1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Psmb3Q9R1P1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms