Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gpc6Q9R087 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gpc6Q9R087 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gpc6Q9R087 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gpc6Q9R087 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gpc6Q9R087 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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