Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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