Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms