Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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