Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3b2Q9JME5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms