Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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