Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms