Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms