Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rb1cc1Q9ESK9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rb1cc1Q9ESK9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rb1cc1Q9ESK9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rb1cc1Q9ESK9 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rb1cc1Q9ESK9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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