Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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DysfQ9ESD7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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DysfQ9ESD7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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DysfQ9ESD7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms