Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hmgn3Q9DCB1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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