Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms