Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg9Q9DB90 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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