Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn34b2Q9D9N2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn34b2Q9D9N2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn34b2Q9D9N2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn34b2Q9D9N2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34b2Q9D9N2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms