Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms