Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms