Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms