Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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