Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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