Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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