Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp4Q9D4F8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tubgcp4Q9D4F8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tubgcp4Q9D4F8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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