Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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