Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed11Q9D2R4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms