Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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