Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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