Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sgo1Q9CXH7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sgo1Q9CXH7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sgo1Q9CXH7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Sgo1Q9CXH7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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