Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrrc17Q9CXD9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Lrrc17Q9CXD9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrc17Q9CXD9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Lrrc17Q9CXD9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrrc17Q9CXD9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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