Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm26657Q9CVR1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms