Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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