Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prps2Q9CS42 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms