Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms